由于寿司大部分材料未经煮熟，在配制过程中比较容易造成微生物超标，寿司易含有微小寄生虫(如生鱼片类寿司)，从而危害到消费者的身体健康。
吃寿司应注意：1、用来准备食用寿司的醋或烧酒并不能把寄生虫的幼虫完全消除或使其停止活跃，有些寄生虫能够在醋里生存多达几十天；2、寿司加工条件、储存条件、保存期限、原料来源等方面要求影响着寿司质量的好坏，消费者应特别注意；3、免疫力较弱的人士(包括孕妇、年长者和长期病患者)最好停止食用，以免发生食物中毒；4、一旦因食用寿司而出现肠胃不适等症状，应立即停止食用，并及时前往医院就诊。
