HGSS和DPt一样，你可以在击败全部馆主后再次进行挑战，但不同的是本作能够挑战的馆主队伍更为庞大了，集结了关东&城都两方面的实力，并且队伍中加入了DP和RS的pm，实力更为强劲（等级压制王道……）
下面便是介绍（详情来自serebii）
再战方式：首先大家要知道馆主也不是死板的人，一辈子都要待在道馆里，所以为了能让他们大驾并且和我们对战，我们就需要跑遍满地图一个个去寻找他们，他们每个星期都会在一个特定的时间外出，这个时间是固定的，而我们的责任就是在这个确定的时间找到他们。找到他们后他们会很乐意地把电话号码留给我们，但是这并不意味着他们是随叫随到的……只有特定的日期他们才会应战，你只要在特定时间约好他们后，他们就会在关东黄金市的柔道馆里等着你，只要你约好他们，他们是不会走的（只有你能放他们鸽子但他们不能……），所以无需担心错过时间。
金银道馆馆主——飞行系阿速
离馆时间：周一白天
可约定再战时间：周六早晨
再战阵容：lv50椋鹰 lv52猫头夜鹰 lv52大王雁 lv54绅士鸦 lv48大嘴鸥 lv56比雕
（这两个真的官配了……）
金银道馆馆主——虫系阿笔
离馆时间：周四白天
可约定再战时间：周四下午
再战阵容：lv48鬼蝉 lv52女王蜂 lv55大甲 lv54赫拉克罗斯 lv52古蜻蜓 lv56钢铁螳螂
金银道馆馆主——普通系小茜
离馆时间：周六白天
可约定再战时间：周六下午
再战阵容：lv54大河狸 lv50圆舌头 lv52皮可西 lv52麒麟奇 lv54优雅猫 lv58大奶罐
金银道馆馆主——幽灵系小松
离馆时间：周一白天
可约定再战时间：周二夜晚
再战阵容：lv52鬼气球 lv52冥巨人 lv52宝石鬼 lv54巫妖 lv57耿鬼 lv57耿鬼
金银道馆馆主——格斗系阿四离馆时间：永远不离开道馆可约定再战时间：周三夜晚再战阵容：lv54恰雷姆 lv52艾比郎 lv55沙瓦郎 lv54蘑菇袋鼠 lv56火爆猴 lv60快泳蛙此人才是真正的彪悍啊，唯一一个一辈子不离开道馆的馆主，你需要在道馆门外找到他的妻子才能获得他的电话号码……金银道馆馆主——钢系蜜柑离馆时间：每日下午可约定再战时间：周三下午再战阵容：lv50钢钟 lv52钢鸟 lv52企鹅皇 lv52合金十字 lv56悬浮磁怪 lv62大钢蛇金银道馆馆主——冰系柳伯离馆时间：周六早晨可约定再战时间：周一早晨再战阵容：lv56雪巨人 lv52鬼面冰 lv52雪女 lv58白海狮 lv54帝王海象 lv60猛犸金银道馆馆主——龙系小湷离馆时间：每日白天可约定再战时间：周五夜晚再战阵容：lv52死机（误，是哈克龙） lv56暴鲤龙 lv52化石翼龙 lv52喷火龙 lv56刺龙王 lv60肥大
关东道馆馆主——岩石系小刚
离馆时间：每日下午
可约定再战时间：周六夜晚
再战阵容：lv55隆隆岩 lv54化石鱼 lv56多刺菊石兽 lv55镰刀盔 lv57战锤龙 lv61大岩蛇
关东道馆馆主——水系小霞
离馆时间：周五夜晚
可约定再战时间：周三早晨
再战阵容：lv56沼王 lv56乘龙 lv54叉尾浮鼬 lv54灯笼鱼 lv60美纳斯 lv60宝石海星
关东道馆馆主——草系莉佳（待补充）
离馆时间：
可约定再战时间：
再战阵容：
关东道馆馆主——毒系阿杏
离馆时间：周五夜晚
可约定再战时间：周三早晨
再战阵容：lv58阿利托斯 lv52毒蟾蜍 lv56双蛋瓦斯 lv55毒龙蝎 lv52叉字蝠 lv59末入蛾
关东道馆馆主——电系马志士（待补充）
离馆时间：
可约定再战时间：
再战阵容：
关东道馆馆主——超能系娜姿
离馆时间：周五夜晚
可约定再战时间：周日下午
再战阵容：lv58太阳精灵 lv56吸盘魔偶 lv54大姨妈 lv53果然翁 lv53超能斗士 lv60胡地
关东道馆馆主——火系夏伯
离馆时间：周二早晨
可约定再战时间：周六下午
再战阵容：lv54煤炭龟 lv57火山骆驼 lv60烈焰马 lv58熔岩蜗牛 lv54黑鲁佳 lv62鸭嘴暴龙
关东道馆馆主——地面系（其实严格说是全能吧……）小茂（待补充）
离馆时间：
可约定再战时间：
再战阵容：lv67椰蛋树 lv69怪力 lv70班吉拉 lv70重甲暴龙 lv68风速狗 lv72比雕
还有一些人物具体位置和个别人物会稍后补充。
